Nat Biotechnol :深度解读!科学家成功清楚地绘制出人类胃的微生态系统目录!

2021-12-06 02:28:41 来源:
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全因,一项刊登在的国际MagazineNature Biotechnology上题为“A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome”的研究课题报告中的,来自欧洲生物新科技Laboratory等的机构的化学家们通过研究课题将全人类肠胃细菌一组中的所有已知的大肠杆菌基因增补转成了一个大型的附录,从而就能为了让研究课题新科技人员系统地即使大肠杆菌基因和蛋白之间的关联,以及其对全人类肥胖的影响。

大肠杆菌遍及生理内之外,其能够产生RNA来影响RX-消化系统、肥胖和对哮喘的易感性,其如此值得注意以至于生理细菌一组转成员的数量要比生理细胞还要多,除此以外大肠杆菌、变形虫和其它细菌;为了理解大肠杆菌在全人类生物学中的所扮演的决定性配角,化学家们通常会在Laboratory中的分开并对其指导,随后在对大肠杆菌进行时DNA测序,然而现今很多大肠杆菌还无法在Laboratory的生态中的被指导猎食。

为了获得这些大肠杆菌的相关信息,研究课题新科技人员采取了另之外一种步骤,他们从生态中的(比如肠胃)得来基本上样本,随后在对整个样本中的的DNA进行时测序,然后可视化步骤对来自基本上样本中的的数千种生境的有机体基因进行时改建,这种步骤被称之为宏基因学新科技,该新科技能作为一种替代步骤对单个生境的DNA进行时分开和测序。

研究课题者Rob Finn暗示,去年除此以外我们在内的三个法理一个团队改建了转成千上万个肠胃细菌一组基因,而仅有的解决办法就是这些一个团队所赢取的结果应该带有直接联系,以及应该能将这些结果增补转成为一个非常上半年的目录。现今研究课题新科技人员已经从全人类肠胃中的超过4600种大肠杆菌群落中的增补了20万个基因和1.7亿个RNA序列,这种新型的附录(并存的全人类胃肠胃基因集合和并存的胃肠胃RNA附录)揭示了RX-肠胃的巨大多元性,并为更进一步进行时肠胃细菌一组研究课题铺平了道路。

研究课题者绘制出的这个巨大的附录是细菌一组研究课题的一个典范,将会或将能为化学家们提供非常宝贵的天然资源来研究课题全人类肠胃生态系统中的每一种大肠杆菌所扮演的决定性配角。这项研究课题表明,超过70%被样品到的大肠杆菌从而在Laboratory中的被转顺利指导过,而其在体内的活性仍然未确定,而这类大肠杆菌中的仅有的社会群体就是Comantemales;研究课题者暗示,看得见Comantemales如此广泛实在一个惊喜,这就彰显了我们的确对肠胃中的的大肠杆菌鲜为人知,我希望这个附录能为了让生物信息学家和生物新科技家在将会几年弥补这一基础知识空白。

该附录/附录得来的所有数据集都能在应用软件天然资源Mgnify中的获得,其能为了让化学家们分析细菌的基因数据集并且与局限性的附录进行时对比;随着多国研究课题一个团队不断公开发表新的附录,该附录有可能扩展到除此以外其它RX-臀部的细菌一组,比如皮肤或口腔内部等臀部。最后研究课题者暗示,这一附录的增补将会或为细菌学家和临床研究课题新科技人员提供非常丰富的天然资源,然而研究课题新科技人员有可能在厄瓜多尔、亚洲和南部非洲等代表性不足的地区注意到越来越多新的大肠杆菌生境,现今研究课题新科技人员并不明了并不相同群体中的大肠杆菌多元性的差异和变化可能。

原始出处:

Alexandre Almeida, Stephen Nayfach, Miguel Boland, et al.A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome.Nat Biotechnol. 2020 Jul 20. doi: 10.1038/s41587-020-0603-3.

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